Australianterrierin terveydenhoitoon kuuluu parhaimmillaan vain säännöllinen rokotuksilla käynti. Kuitenkin, kuten kaikilla roduilla, myös australianterriereillä on olemassa rodulle tyypillisiä sairauksia, joiden hoitamiseksi koira voi joutua käymään eläinlääkärin luona useammin. On suositeltavaa, että koira käytetään vähintään kerran, mieluiten parikin kertaa sen aikuiselämän aikana virallisessa silmätarkastuksessa, jossa todetaan koiran silmien terveys, sekä vähintään kerran virallisessa polvitarkastuksessa.
Australianterrieriä voi pitää suhteellisen pitkäikäisenä rotuna. Keskimääräinen ikä lienee rodussa noin 10-12 vuotta. Neljätoistavuotiaat australianterrierit eivät ole kuitenkaan harvinaisia ja 16-17 – vuotiaita australianterriereitä tavataan myös silloin tällöin.
Australianterrierikerhon jalostustoimikunta kerää tietoa australianterriereiden terveydestä kasvattajilta ja koirien omistajilta. Rotu ei kuulu PEVISA:n eli perinnöllisten vikojen ja sairauksien vastustamisohjelmaan.